Terdapat tiga starter Pokemon seperti pada seri-seri game sebelumnya, yakni Chespin tipe Grass, Fennekin tipe Fire, dan Froakie tipe Water.
Pada masing-masing game terdapat Legendary Pokemon eksklusif yang menjadi simbol pada game tersebut. Pada Pokemon X terdapat Xerneas Legendary Pokemon tipe Fairy, sedangkan di Pokemon Y terdapat Yveltal Legendary Pokemon tipe Dark-Flying. Selain itu terdapat eksklusif Mega Evolution untuk tiap game pada Pokemon X terdapat Mega Mewtwo X tipe Psychic-Fight dan Mega Mewtwo Y tipe Psychic pada Pokemon Y. Sebagai catatan Mega Mewtwo merupakan Mega Evolution dari Mewtwo, yang sempat disebut sebagai 'Mewthree'.
Eevee memiliki wujud evolusi baru yakni Sylveon tipe Fairy.